総会は4年に1度開かれており、内容は学術講演と展示の2つが柱となる。市民向けの博覧会（4月2日〜10日、東京ビックサイトと大手町・丸の内エリア）と医師やコメディカルなど医療関係者向けの学術展示（4月7日〜10日、東京ビックサイト）、医療関係者向けの学術講演（4月8日〜10日、東京国際フォーラム）が行われる。

　博覧会では市民を対象に、体や病気のメカニズム、最新の治療法など、健康への理解を深めてもらうための展示が行われる。一般を対象とした参加型のイベントも盛りだくさんで、「頚動脈エコー検査」や「血圧脈波測定」、「血管内皮機能検査」などを無料で受けられる健診体験も行われる（一部、事前予約が必要）。

　学術展示は、テーマ展示や一般出展展示を通じて、医療の最前線で活動する臨床医や研究開発者との対話を通じて、医学・医療の最前線を俯瞰的に知ることができる内容。「糖尿病診療 新時代」、「人工臓器と再生医療がつくる21世紀の最先端医療」などのテーマ展示のほか、学会や企業などの一般展示も行われる。

　展示会はいずれも入場無料。

　学術講演では、「先端医療・医学」、「からだの調節と代謝」、「中央診療部門の最前線」、「チーム医療」、「社会と医療」、「健康社会の実現」、「高齢社会」、「医療人の働く環境を考える」など20の大項目に分け、250以上のセッションが行われる予定。

　特別講演として「わが国の循環器疾患の変遷と生活習慣との関連」、「ゲノム情報を利用したエビデンスに基づく個別化医療」、「生活習慣病とアディポサイエンス」、「iPS細胞研究の進展」なども行われる。

　特別企画として「病院と勤務医の未来をひらく」、「社会システムとしての医療の将来像」、「わが国の研究医の養成」、「臨床実習の現状と課題」のほか、市民に健康・医療への理解を深めてもらい、日本の医療が抱えるさまざまな問題について話し合うプログラム「市民公開シンポジウム―みんなで考える新しい医療―」も開催される。